कार्यकालको सुरुवातमा चलाएको संगठन शुद्धिकरण अभियानका कारण प्रधानसेनापनि पूर्णचन्द्र थापाले संगठनभित्र र बाहिरबाट वाहवाही पाए । तर, कार्यकालको उत्तरार्द्धतिर आइपुग्दा नेपाली सेना आलोचनाको शिखरमा मात्र पुगेको छैन, रक्षामन्त्री ईश्वर पोखरेलसँग पनि तिक्तता बढेको छ ।
